在本篇文章中将解释高斯混合模型(GMM)的关键部分背后的数学原理,即指望最大化(EM),以及如何将这些概念转换为Python。这个故事的重点是EM或M-Step。算法
注意:这不是有关端到端GMM算法的全面说明。要进行更深刻的研究,请参阅咱们之前翻译的文章。数组
指望最大化
GMM中有一系列步骤,一般称为“指望最大化”,简称“ EM”。要解释如何理解EM数学,请首先考虑您可能要处理的模型。微信
样本由图形上的点表示。这些点造成一些不一样的斑点。每一个斑点都有一个中心,每一个点都与每一个斑点的中心相距必定距离。给定GMM模型数据,目标一般是根据最接近的中心按其样本点标记其余样本。有些点距离一个或多个中心几乎相等,所以,咱们但愿基于某种几率来标记点。
机器学习
EM用到的符号
要学习如何学习机器学习算法,您一辈子中须要一些希腊语。由于算法中符号基本上都是以希腊文表示的。尽管可能会想掩盖基础知识,可是对单个希腊字母的简单掌握能够帮助您理解算法中的重要概念。ide
算法可能会使人生畏且使人困惑。例如,乍看之下,高度集中的希腊符号有时足以令人窒息。可是不要浪费时间,咱们在这里只要考虑如今要使用的符号便可学习
除此之外,咱们也有一些英文字母在EM中表明GMM的意思。一般,英文字母围绕着希腊字母,就像小领航鱼围着大鲨鱼游动。就像小鱼同样,英文字母有一个重要的做用,它为如何解释算法提供了指导。
优化
M-Step的数学解释
如今咱们已经隔离了方程的每一个组成部分,让咱们经过检查M-Step,将它们组合成一些经常使用的数学短语,这些短语对于用EM语言进行对话很重要。this
簇,高斯,字母J或K,有时还包括C:一般都是同一件事-若是咱们有3个簇,那么您可能会听到“每一个高斯”,“每一个j”,“每一个高斯j”或 “对于每一个K组件”-这些都是谈论相同3个簇的不一样方法。在数据方面,咱们能够绘制(x,y)样本/点的数组,并查看它们如何造成簇。url
# a 2D array of samples [features and targets]
# the last column, targets [0,1,2], represent three clusters
# the first two columns are the points that make up our features
# each feature is just a set of points (x,y) in 2D space
# each row is a sample and cluster label
[[-7.72642091 -8.39495682 2. ]
[ 5.45339605 0.74230537 1. ]
[-2.97867201 9.55684617 0. ]
[ 6.04267315 0.57131862 1. ] ...]
软分类(Soft Assignments),几率,响应度(Responsibility):聚类的一个主要思想是咱们但愿为每一个样本找到一个数字,以告诉咱们样本属于哪一个聚类。在GMM中,对于咱们评估的每一个样本,咱们可能会返回表明“每一个高斯j的响应度”,每一个“软分类”或每一个“几率”的值。spa
这些阶段一般都是关于同一件事的,但响应度与几率之间存在关键区别。
# an array of assignment data about the 2D array of samples
# each column represents a cluster
# each row represents data about each sample
# in each row, we have the probability that a sample belongs to one of three clusters - it adds up to 1 (as it should)
# but the sum of each column is a big number number (not 1)
print(assignments)
# sample output: an array of assignment data
[[1.00000000e+000 2.82033618e-118 1.13001412e-070]
[9.21706438e-074 1.00000000e+000 3.98146031e-029]
[4.40884339e-099 5.66602768e-053 1.00000000e+000]...]
print(np.sum(assignments[0])
# sample output: the sum across each row is 1
1
print(np.sum(assignments[:, 0])
# sample output: the sum in each col is a big number that varies
# Little Gamma: the really small numbers in each column
# Big Gamma: the sum of each column, or 33.0 in this sample33.0
大写伽玛,小写伽玛,J,N,x和i:EM中的核心任务是为每一个群集优化三组参数,或者“对于每一个j,优化w(𝓌),mew(𝜇 )和方差(𝜎)。” 换句话说,群集的权重(𝓌),群集的中心点(𝜇)和群集的方差(𝜎)是多少?
对于权重(𝓌),咱们将“大写伽玛”除以特征总数。从更早的时候开始,咱们就知道每一个聚类j的大写伽玛只是将给定聚类的每一个样本的分配值相加的结果(该数字之和不等于1)。以下图所示
对于EM期间高斯的权重参数,请考虑一些简单的事情,例如添加数字列表,而后将其除以样本总数。
对于mew (𝜇),不是像咱们以前那样将全部小写伽玛加到一个小写伽玛中,而是对每一个聚类j和每一个样本i将小写伽玛与特征x进行矩阵乘法。以下图所示
请记住,mew只是每一个簇的中心点-若是咱们有3个簇,而咱们的样本都是x,y坐标,那么mew将是3个x,y坐标的数组,每一个簇一个。
# for figure 4 - mew (mu)
# same array of assignment data as before
# each column is a cluster of little gammas
print(assignments)
[[1.00000000e+000 2.82033618e-118 1.13001412e-070]
[9.21706438e-074 1.00000000e+000 3.98146031e-029]
[4.40884339e-099 5.66602768e-053 1.00000000e+000]...]
# the little gammas of cluster 0 is just column 0
[[1.00000000e+000 ]
[9.21706438e-074 ]
[4.40884339e-099 ]...]
# same array of sample data as before
# the first two columns are the x,y coordinates
# the last column is the cluster label of the sample
print(features)
[[-7.72642091 -8.39495682 2. ]
[ 5.45339605 0.74230537 1. ]
[-2.97867201 9.55684617 0. ]
[ 6.04267315 0.57131862 1. ] ...]
# for features, we just need its points
[[-7.72642091 -8.39495682 ]
[ 5.45339605 0.74230537 ]
[-2.97867201 9.55684617 ]
[ 6.04267315 0.57131862 ] ...]
# if using numpy (np) for matrix multiplication
# for cluster 0 ...
big_gamma = np.sum(assignments[:, 0]
mew = np.matmul(assignments[:, 0], features) / big_gamma
# returns an array of mew
[[-2.66780392 8.93576069]
[-6.95170962 -6.67621669]
[ 4.49951001 1.93892013]]
对于方差(𝜎),请考虑到如今,咱们有了点和中心点-随着方差的出现,咱们基本上正在评估每一个样本的点(每一个i的x)到每一个群集的中心点(每一个i的mew)的距离。用EM语言来讲,有些人可能会说“ x_i减去mew_i乘以Big Gamma j。”
# for figure 5 - variance
# a sampling of variance for cluster 0 of n clusters
# given arrays for features and assignments...
x_i = features
big_gamma = np.sum(assignments[:, 0]
mew = np.matmul(assignments[:, 0], features) / big_gamma
numerator = np.matmul(assignments[:, 0], (x_i - mew) ** 2)
variance = numerator / big_gamma
# returns an array of variance
[[0.6422345 1.06006186]
[0.65254746 0.9274831 ]
[0.95031461 0.92519751]]
以上步骤都是关于EM中的M-Step或最大化-全部关于权值、mew和方差的都是关于优化的;可是,初始赋值数组呢?咱们如何获得每一个样本的几率数组这是EM中的E-Step,也就是指望。
在E-Step中,咱们尝试用贝叶斯规则猜出每一个点的分配-这会产生一组值,这些值指示每一个点对高斯的响应度或几率。最初会与猜想值(后验值)相差很远,可是在经过E-Step和M-Step循环以后,这些猜想会变得更好,更接近客观的地面真理。
GMM算法重复M-Step 和 E-Step直到收敛。例如,收敛性多是迭代的最大次数,或者当每轮猜想之间的差别变得很是小时。但愿最终的结果是,数据中的每一个样本都有一个软分配的标签。
总结
在这篇文章中,我介绍了M-Step的高斯混合模型算法的指望最大化阶段的导航部分的理解。虽然从表面上看,数学彷佛太复杂而没法处理,但咱们能够经过理解其各个部分来处理其复杂性。例如,一些关键的理解,如发音的希腊符号和应用它们的操做与NumPy是重要的,以掌握整体概念。
做者:Justin Chae
原文地址:https://towardsdatascience.com/unlock-m-step-from-em-in-gmm-dd9a32a0aa6f
deephub翻译组
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