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TFTG:human转录因子靶基因数据库
时间 2021-01-18
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欢迎关注”生信修炼手册”! 研究转录因子调控的靶基因有两种常用的手段,第一种就是利用chip-seq等方式,研究特定转录因子在基因组的结合位置,从而判断其调控的基因,因为有实验证据的支持,所以这种方式得到的调控基因会更加可信,存在的问题就是peak calling时的假阳性率问题。 另外一种方式是建立在转录因子的motif已知的情况下,可以采用FIMO等软件在基因的启动子序列上进行查找,如果能够匹
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