生信自学笔记（五）计分矩阵的实例

氨基酸替换矩阵 PAM 替换矩阵 PAM（Point Accepted Multation) 是基于进化的点突变模型产生的，若是两种氨基酸替换频繁，说明天然界接受这种替换，那么这对氨基酸替换得分就高。一个 PAM 就是一个进化的变异单位, 即 1% 的氨基酸改变，但这并不意味 100 次 PAM 后，每一个氨基酸都发生变化，由于其中一些位置可能会通过屡次突变，甚至可能会变回到原来的氨基酸。web

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