生信自学笔记（五）计分矩阵的实例

氨基酸替换矩阵 PAM 替换矩阵 PAM（Point Accepted Multation) 是基于进化的点突变模型产生的，如果两种氨基酸替换频繁，说明自然界接受这种替换，那么这对氨基酸替换得分就高。一个 PAM 就是一个进化的变异单位, 即 1% 的氨基酸改变，但这并不意味 100 次 PAM 后，每个氨基酸都发生变化，因为其中一些位置可能会经过多次突变，甚至可能会变回到原来的氨基酸。 PAM

>>阅读原文<<