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使用TCGAbiolinks分析TCGA中的表达谱数据
时间 2021-01-14
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欢迎关注”生信修炼手册”! 对于转录组数据而言,差异分析和富集分析是最核心的分析内容之一,通过TCGAbiolinks可以轻松实现TCGA表达谱数据的下载,差异分析,富集分析等功能,以乳腺癌的基因表达谱为例,分析过程如下 1. 下载原始数据 由于TCGA中乳腺癌的样本很多,所以只挑选了部分样本来测试,下载的过程如下 2. 差异分析 详细步骤如下 对数据进行预处理,根据样本间的斯皮尔曼相关系数去除相
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