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使用TCGAbiolinks进行生存分析
时间 2021-01-13
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欢迎关注”生信修炼手册”! TCGAbiolinks不仅提供了数据的下载功能,还提供了各种各样的下游分析功能,生存分析是TCGA数据最经典的应用场景之一,通过TCGAbiolinks可以轻松实现生存分析。 在进行生存分析之前,首先要得到患者的临床数据。在之前的文章中介绍了通过GDC来下载临床数据的方法,在GDC中临床数据有两种形式 XML 每个样本的所有临床信息以XML的格式进行存储,该文件中包含
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