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使用TCGAbiolinks进行甲基化和转录组数据的联合分析
时间 2021-01-19
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python
数据分析
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Python
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欢迎关注”生信修炼手册”! DNA甲基化作为表观遗传的一种重要标记,在基因表达调控中发挥重要作用,已有研究表明,位于启动子区的甲基化会抑制基因表达。结合甲基化数据和基因表达谱数据,可以更好的分析甲基化的调控功能。 通过TCGAbiolinks不仅仅可以对某种类型的数据进行分析,还可以进行多组学数据的联合分析,DNA甲基化和基因表达谱数据的联合分析过程如下 1. 甲基化芯片数据 以肾上腺皮质癌为例,
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