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bsseq 进行差异甲基化分析
时间 2021-01-19
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bsseq 主要用来分析WGBS的数据, 安装过程如下 source(“http://bioconductor.org/biocLite.R“) biocLite(“bsseq”) bsseq的分析主要包括以下4步: 读取原始数据 BSmooth t-test检验 DMR 1. 读取原始数据 bsseq要求的原始数据格式如下: 共6列数据,制表符分隔,每一行代表一个甲基化位点,前5列很好理解,描述
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