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#TCGA系列#TCGA基因/miRNA表达谱数据整合(二)
时间 2019-12-07
标签
tcga
系列
基因
mirna
表达
数据
整合
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上期(#TCGA系列#TCGA基因/miRNA表达谱数据整合)使用shell 对多样本表达谱文件整合,实现方式是将1881个miRNA和425个样本直接存入一个"awk二维表"而后输出,所有在内存中运行,因此速度极快. 但shell中已经提供了专门整合文本的命令join,能够用于两个文本的合并.本期介绍join命令的语法以及使用join整合miRNA表达谱数据.shell 先从一个例子介绍j
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