蛋白-小分子对接(含同源建模)

1.项目说明 采用同源模建方法构建单链抗体(以下简称“抗体”)的三维结构,通过分子对接方法预测化合物的结合模式(图 1)。 图1.化合物两种构型的化学结构 2.计算方法 本研究采用的计算方法简述如下(详见《计算方法》文档): A.采用在线工具PIGSPro预测抗体的三维结构,通过分子动力学模拟优化结构; B.采用在线工具POCASA 1.1预测优化的抗体结构上潜在的结合位点; C.采用DOCK 6
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