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蛋白质同源建模的十个技巧
时间 2021-01-12
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目录 前言 文章内容 一、文章介绍 1.目的 2.背景 二、十个建模技巧 1.模板选择 2.阅读发表的相应模板三维结构的文章 3.去除不必要的元素、溶剂、配体和离子 4.优化3D结构,如果氢丢失要补回氢 5.留意比对过程的gaps 6. 进行loop建模时要考虑loop大小以及残基组成 7.在进行计算分析前,进行结构最小化是必不可少的 8.使用多种策略进行三维结构的验证和评估 9.考虑氨基酸质子化
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