浅谈后缀数组SA

这篇博客不打算讲多么详细，网上关于后缀数组的blog比我讲的好多了，这一篇博客我是为本身加深印象写的。

给大家分享了那么多，容我自私一回吧~

参考资料：这位dalao的blog

1、关于求SuffixArray的一些变量定义：

1. sa[i]=j，表示第i名的后缀从j开始

**存的是下标**

2. rnk[i]=j，从i开始的后缀是第j名的

**与sa为互逆运算，存的是值**

3. tp[i]=j, 第二关键字为i的后缀从j开始

**可理解为第二关键字的SA，存的是下标**

插入解释一下第一关键字和第二关键字：

咱们要对全部的后缀进行排序，怎么排呢？

开始时，咱们每一个字符的后缀存的只有它本身，因此它后缀的大小就是它的ASCII码。

咱们把每一个字符i当作(s[i],i)的二元组，若是咱们直接丢pair<int,int>里面而后std::sort，

这样的时间复杂度是O(log^2 n)的，显然不够优秀。

因此就须要用到基数排序RadixSort，不了解的自行百度。

再使用倍增法，就可使咱们排序的时间复杂度下降到O(logn)。

因此咱们要对每一个后缀的前两个字母进行排序，第一个字母的相对关系已经获得了。

第i个后缀的第二个字母，就是第i+1个后缀的第一个字母，利用这个关系咱们第二个字母的相对关系也就知道了。

咱们的tp数组就是用来记录它的，rnk[i]表示上一轮中第i个后缀的排名。

这里引用神仙attack的一句话，我以为讲的很是到位：

对于一个长度为w的后缀，你能够形象的理解为：

第一关键字针对前w2个字符造成的字符串，第二关键字针对后w2个字符造成的字符串

而后对每一个后缀的前4个字母组成的字符串排序，前8个，前16个...这就是倍增法求SA的流程了。

给出RadixSort的代码：

void RadixSort(int a[],int b[]){//基数排序 
    for(int i=0;i<=m;i++)tax[i]=0;
    for(int i=1;i<=n;i++)tax[a[i]]++;
    for(int i=1;i<=m;i++)tax[i]+=tax[i-1];
    for(int i=n;i>=1;i--)sa[tax[a[b[i]]]--]=b[i];
}

实在不能理解RadixSort也没有关系，代码很短

再给出求SA的代码：

bool cmp(int *r,int a,int b,int k){
    return r[a]==r[b]&&r[a+k]==r[b+k];
}
void getSA(int a[],int b[]){
    for(int i=1;i<=n;i++)
        m=max(m,a[i]=s[i]-'0'),b[i]=i;
    RadixSort(a,b);
    for(int p=0,j=1;p<n;j<<=1,m=p){
        p=0;
        for(int i=1;i<=j;i++)b[++p]=n-j+i;
        for(int i=1;i<=n;i++)if(sa[i]>j)b[++p]=sa[i]-j;
        RadixSort(a,b);
        int *t=a;a=b;b=t;
        a[sa[1]]=p=1;
        for(int i=2;i<=n;i++)
            a[sa[i]]=cmp(b,sa[i],sa[i-1],j)?p:++p;
    }
}

关于代码的解释，有时间再填坑。本蒟蒻要学的算法还不少...SA就粗略地理解一下好了

开始填坑，先补充一个东西叫height数组。

height[i]表示排名为i的后缀和排名为i-1的后缀的最长公共前缀LCP。

暴力求解时间复杂度是O(n^2)，根据一个性质height[i+1]>=height[i]-1

能够O(n)时间内求出height数组，具体代码：

 

void getHeight(){
    for(int i=1,j=0;i<=n;i++){
        if(j)j--;
        while(s[i+j]==s[sa[rnk[i]-1]+j])j++;
        height[rnk[i]]=j;
    }
}

 关于这个height数组，它能够干什么，给出一张列表：

两个后缀的最大公共前缀

lcp(x,y)=min(heigh[x−y])lcp(x,y)=min(heigh[x−y])， 用rmq维护，O(1)查询

可重叠最长重复子串

height数组里的最大值

不可重叠最长重复子串

首先二分答案x，对height数组进行分组，保证每一组的最小height都>=x

依次枚举每一组，记录下最大和最小长度，若sa[max]−sa[min]>=x那么能够更新答案

本质不一样的子串的数量

枚举每个后缀，第i个后缀对答案的贡献为len−sa[i]+1−height[i]