Gromacs基于OPLS-AA力场的聚合物建模及模拟

本文内容包括： OPLS-AA力场简介/高分子模拟常用力场； 聚合物建模方法； Gromacs添加非标准残基建模聚合物的方法； 聚合物PDB文件生成； 开始模拟。 第一步： 尽管Gromacs与Amber都包含适合蛋白质与核酸体系模拟的力场，但到目前为止罕有专为人工聚合物体系开发的力场。不同于蛋白质/核算具有有限种类的残基，聚合物原则上可以有无限种不同的单体，去为每一种单体都设定优化参数是不可能的

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