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Gromacs/模拟基本流程
时间 2021-01-12
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Gromacs/模拟基本流程 可以使用以下步骤进行Gromacs的初步模拟: 产生模拟必须的 .gro文件 .itp文件 和 .top文件(比如从蛋白数据库下了一个pro.pdb蛋白质结构文件) 输入为:pro.pdb 输出为:pro.gro topol.top posre.itp 命令为:pdb2gmx -f pro.pdb -water tip4p (-o pro.gro) -ter -ign
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