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bedGraph,bed以及bam文件格式转换
时间 2019-12-13
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感兴趣的基因信息包含在bedGraph文件中,下面命令是对其文件格式进行转换,通常进行到bam文件可视化的效果比较好。工具 1. bedGraph转bed文件 BedGraph ,的数据和bed文件很相似,ChIPseq数据作完peak calling后的bed文件最短只有三列,染色体序号,染色体起始位置和结束位置。以下所示,前面的声明和Wig相似,后面的四列分别表示染色体序号,起始位置,结束位置
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