生物信息学入门 GEO芯片数据差别表达分析时是否须要log2以及标准化的问题

GEO中的Series Matrix File(s)一般是通过了标准化和对数转换的数据。但不全是。在实际应用的时候须要根据状况判断一下。对于芯片数据，可能做者将.cel的文件处理成未标准化的数据直接上传。通常来讲，在判断counts是否须要从新标准化以及是否须要log2时，能够根据数值大小粗略估计。ide 若是表达丰度的数值在50之内，一般是通过log2转化的。若是数字在几百几千，则是未经转化的。

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