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使用QTLseqr进行BSA-seq分析
时间 2020-05-15
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使用
qtlseqr
进行
bsa
seq
分析
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QTLseqr是一个用于BSA-seq的R包,它可以读取GATK输出结果进行过滤,最终使用SNP-index和G 统计值的方法进行定位。咱们此次尝试使用这个R包来替代咱们本身手撸代码来分析一批水稻BSA数据,文章的数据在如何使用BSA方法进行遗传定位(水稻篇)提供了下载连接。git 首先是安装和加载R包,因为QTLseqr目前托管在GitHub上,所以须要用devtools才能安装。github
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