序列比对(二)——Needleman-Wunsch算法之仿射罚分

原创: hxj7 关于全局比对Needleman-Wunsch算法的介绍及线性罚分的实现代码请参考序列比对(一)全局比对Needleman-Wunsch算法。 概念引用如下: 线性罚分,即penalty=g*d,其中g为空位长度,d为一个空位的罚分。 仿射型罚分,即penalty=d+(g-1)*e, 其中g为连续空位的长度,d为连续空位中第一个空位的罚分,e为连续空位中第2个及以后空位的罚分。
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