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动态编程之序列比对:Needleman-Wunsch 算法和Smith-Waterman算法
时间 2021-01-21
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1. 加分规则 S(a,b) = 10 (a=b) S(a,b) = -3(a!=b) S(a,b) = -5(a='_' or b='_') 通常DNA和RNA,Protein都有打分矩阵,Protein常用打分矩阵BLOSUM62 2. 动态规划算法: 全局比对算法Needleman-Wunsch思路:从第一个到最后一个,一个个比,一条序列比个遍,然后得出最优解 example: 局部比对Sm
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