Graphpad Prism 堆叠图

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若是说饼图是“掰弯”的单列堆叠图，那么堆叠图则是排排站的“刚直”饼图，详情参考《ggplot2“掰弯”条形图实操教程》一文。其实，堆叠图比饼图更强大，在展现系列数据的百分比同时还能够展现不一样比例的变化规律。好比，微生物组学中，它能够很好地展现出微生物种群的丰度变化。

堆叠图通常有两种：直接“堆叠”原始数据（第一种）或者“堆叠”原始数据的“百分比”（第二种）。下面使用不一样物种（细菌）的绝对丰度数据为例为你们演示这两种堆叠图的绘制方法。

第一种

本文所用数据来自基迪奥生物的16s范例结题报告（12个样本），以下。

打开软件后，经过双击窗口灰色区域或点Prism(棱镜)的小三角，新建工程文件。在弹出的向导窗口选择表格类型为Grouped，以下图。

将数据复制粘贴到Prism的表格中，接下来须要对数据矩阵作转置，点击Analyze按钮，计算方法选Transpose X and Y，以下：

转置参数的设置保持默认便可，以下：

转置效果以下，固然也可在Excel中作完转置再粘贴到Prism中，这里主要仍是想为你们介绍下Prism的分析功能。接着点击Graphs选项下新生成的图表，选择相应的图表类型。

堆叠图在Grouped 的summary data选项下，以下图。

接着对图表作一些个性化的调整，好比改变颜色、调整坐标轴的粗细等，这些操做在以前的教程已反复出现过，这里不作赘述。这里重点介绍一个很是好用的功能：反转堆叠顺序。

除了反转柱状图的堆叠次序以外，还能够反转相应的图例顺序，这样就能够方便地把“Unclassified”置于最“底”层，以下图。

第二种

首先，咱们须要先对转置后的数据进行处理：计算每一个物种的绝对丰度占比（即相对丰度）。点Analyze 按钮，计算方法选Fraction of total，以下：

计算方式选择按行计算，计算结果以百分数的方式显示（最大值为100），设置以下：

而后打开计算结果页面，在Graph选项下新建图表，图表类型选择堆叠图，以下：

而后只须要对图表作些个性化的调整便可，好比，颜色能够选择只有两种色相的渐变色。图例的位置还能够本身调整，好比分红两列置于图表的下方等，这里不作赘述。

最终的效果以下：

最后，你也能够直接使用相对丰度绘制百分比堆叠图，这样就不须要用Prism计算百分数啦！若是你想学习Prism这个软件能够点击 阅读原文，观看刚上线的Graphpad Prism科研做图系列视频教程，好啦，今天的内容就到这里啦！

 

纵坐标改成百分数，首先data表的数据要是percentage而不是fraction，即45%在表格中显示为45，做图时坐标范围在0~100，设置坐标轴格式，在Format Axes→Suffix处填上%便可