空间转录组第三讲：图像手动对齐

前面介绍Space Ranger的使用的时候有提到过，一种是自动对齐（只需要提供图片文件），另外一种是手动对齐（除了需要提供图片文件，还需要提供图像组织位置跟spot对应信息的json文件）。今天来介绍一下10x空间转录组Visium 的图像手动对齐。 Space Ranger管线使用 自动图像检测算法 来计算基准标记的位置，并找到组织的边界。10x Genomics在各种各样的H＆E图像，组织和

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