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16s扩增子分析注意事项和经验总结Tips
时间 2021-01-16
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宏基因组
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个人1年多16s/ITS扩增子分析中积累的点点滴滴,此文适合新人了解相关零散知识,也适合有分析经验的人交流与讨论。 以下分析的经验,是以测序数据类型为Illumina HiSeq 2500产出的双端250数据类型(PE250)为基础。 扩增测序技术选择:推荐使用PE250,性价比超高; 原始数据使用fastqc质量评估,会发现数据右端末端质量较差,这是测序仪原理导致,我们在双端合并时还会利用另一端
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