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16s rDNA数据分析经验总结
时间 2021-01-07
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原文来自fanyucai博文,有修改和删减。 去除嵌合体序列,推荐使用UCHIME 多样性中,距离选择现在包括两种,一种是物种距离(Jaccard\Bray-Curtis);另一种是基于进化的距离(Unifrac),基于进化的距离还包含权重和非权重两种,虽然含有进化信息但是,进化信息并不是越多越好,在结果呈现上,这两种我们都应该关注结果。距离一般分为离散和连续两种,由于物种的分布上,主要是离散的量
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