RNA-seq中的基因表达量计算和表达差别分析

差别分析的步骤： 1）比对； 2） read count计算； 3） read count的归一化； 4）差别表达分析；算法 背景知识： 1）比对： 普通比对： BWA，SOAP 开大GAP比对：Tophat（Bowtie2）； 2） Read count(多重比对的问题）： 丢弃 平均分配 利用Unique region估计并从新分配 表达量计算的本质 目标基因表达量相对参照系表达量的数值。 参

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