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三代转录组系列:使用Cogent重建基因组编码区
时间 2021-01-14
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尽管目前已测序的物种已经很多了,但是对于一些动辄几个G的复杂基因组,还没有某个课题组有那么大的经费去测序,所以仍旧缺少高质量的完整基因组,那么这个时候一个高质量的转录组还是能够凑合用的。 二代测序的组装结果只能是差强人意,最好的结果就是不要组装,直把原模原样的转录组给你是最好的。PacBio Iso-Seq 做的就是这件事情。只不过Iso-Seq测得是转录本,由于有些基因存在可变剪切现象,所以所有
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