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使用Canu对三代测序进行基因组组装
时间 2020-12-31
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Canu简介 Canu是Celera的继任者,能用于组装PacBio和Nanopore两家公司得到的测序结果。 Canu分为三个步骤,纠错,修整和组装,每一步都差不多是如下几个步骤: 加载read到read数据库,gkpStore 对k-mer进行技术,用于计算序列间的overlap 计算overlap 加载overlap到overlap数据库,OvlStore 根据read和overlap完成特
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