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samtools获取uniq reads
时间 2019-12-10
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uniq
reads
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参考地址:
https://www.biostars.org/p/56246/
-q INT only include reads with mapping quality >= INT [0]
Like for getting the unique reads (a single read mapping at one best position)
命令以下,也有文献报告使用的
-q 2
samtools view -bq 1 file.bam > unique.bam
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