ChAMP 分析甲基化芯片数据-EpiMod篇

DNA甲基化会调控基因的表达水平，进而影响基因的相互作用。将基因的相互作用网络和差异甲基化信息结合起来，基于那些甲基化水平发生差异的基因，从整个相互作用网络挖掘出这些基因的相互作用模块，这些模块可以看是与样本表型数据相关的基因集合，这种研究方式叫做Functional Epigenetic Modules(FEMs), 也叫做hotspots。 在ChAMP中，通过champ.EpiMod函数进行

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