如何在R中优雅地绘制相关系数矩阵机器学习
install.packages("psych") install.packages("corrplot")#安装包,若是已安装,请略过 library(psych) library(corrplot)#载入两个包 data(iris)#机器学习经常使用神奇数据集——鸢尾花数据集 head(iris)#查看下数据集前五行 irisnew<-iris[,-5]#去除第五列种类变量 cormat<-corr.test(irisnew)#相关系数分析及显著性检验 #最简单的相关系数矩阵可视化 corrplot(cormat$r)
corrplot(cormat$r,method="square")
corrplot(cormat$r,method = "number")
corrplot(cormat$r,method = "shade")
corrplot(cormat$r,method="ellipse")
corrplot(cormat$r,method = "pie")
corrplot(cormat$r,method="square",type="lower",title = "Correlation of iris")
#含显著性检验的相关系数矩阵可视化 cormatp<-cormat$p#单独取出p值矩阵 cormatp[upper.tri(cormatp)]=0#设置p值矩阵上三角等于0 corrplot(cormat$r,method="square",type="lower",title = "Correlation of iris",tl.cex=1.5,tl.pos = "lt",number.cex=1,p.mat=cormatp,sig.level=0.05,insig=c("pch"))
corrplot(cormat$r,method="square",type="full",title = "Correlation of iris",tl.cex=1.5,tl.pos = "lt",number.cex=1,p.mat=cormatp,sig.level=0.05,insig=c("pch"))
corrplot.mixed(cormat$r,upper = "square",lower = "number",diag = "u",tl.cex=1.5,tl.pos = "lt",number.cex=1,p.mat=cormatp,sig.level=0.05,insig=c("pch"))