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从宏基因组序列中提取16S序列
时间 2020-02-12
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基因组
序列
提取
16s
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实际构建系统发育树中,因为全基因组太大,咱们无法对其全部基因进行对齐以及系统发育树的构建,这时候咱们能够提取基因组中的一些分子标记基因及保守基因进行系统发育树的构建。 咱们用REAGO对shutgun 测序数据中的进行16S序列进行抽提,好比作完质控后的双端fasta序列,那么咱们就能够把其对应的16S序列从宏基因组数据中提取出来用于物种鉴定以及系统发育树的构建。python 优势:从宏基因组
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