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用R语言绘制显示taxa特征值的散点图
时间 2021-01-13
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在系统发育分析时,经常会对树上taxa的性状进行描述性统计。对于离散型的变量,R中各种包(APE,phytools,etc)自带的函数可以较好解决问题,但对于连续型变量(如体长、体重等),则没有对应的函数进行显示。 其实,可以通过Hmisc包中的dotchart3函数绘制“克利夫兰点图”,再将其拼接到系统发育树上解决此问题。效果如下图: 图中,系统发育树右侧的dot p
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