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autodock-vina分子对接
时间 2021-01-22
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autodock-vina分子对接 1.蛋白质的处理 从蛋白库里获取蛋白质的初始结构文件http://www.rcsb.org/ 这里我们选用3HTB蛋白复合物文件,用可视化软件打开pdb文件,这里选用pymol软件查看 我们去除掉水分子以及配体,在右侧3htb中点A,选择remove waters ,再点中右下角S,拖动序列栏,在序列栏中选中其他小分子配体,在右侧sele中点A,选择remove
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