高通量数据中批次效应的鉴定和处理(二)

前文讲了什么是批次效应和有哪些影响,我们继续往下看…… 怎么确认数据有无受到批次效应影响 通过样品的层级聚类热图+样品属性信息的注释来展示样品聚类结果有无受批次效应的影响。如下面右图中可见WT_1样品在聚类分支上与其它样品处于不同的分支,而从列注释图可以看到WT_1的seqPlatform和batch信息与其它样品不同,这是给我们的一个提示可能存在批次效应影响。 通常我们在整合多套数据集进行展示时
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