Microbiome: 16S rRNA基因拷贝数应该被校正吗?

摘要: 16SrRNA基因是微生物生态学中应用最广泛的标记基因,通常根据16S测序结果来估计微生物群落中细菌和古菌的比例。然而由于不同生物体含有不同的16S基因拷贝数(gene copy numbers, GCNs),更大GCNs的分支往往会在测序中得到更多的序列,从而使得结果的相对丰度高于实际值。近来,一些基于测序基因组来预测GCNs的方法陆续被开发出来,这些方法使用了系统发育的方法以纠正前述偏
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