转录组测序多少生物重复合适?2个?3个?48个?

2016年英国邓迪大学的Geoffrey J Barton教授在RNA发表一篇文章专门评估这一问题。作者对野生型和snf2突变型酵母样品分别测序了48个生物学重复;质控后,野生型样品保留42个生物学重复,突变型样品剩余44个生物学重复。 在控制假阳性率为0.05的标准下,用所有可用生物重复计算出的差异基因定义为该差异基因鉴定工具的金标准差异基因集。 作者评估了11个常用的差异基因分析工具,性能最好
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