bam文件softclip ， hardclip ，markduplicate的探究
测序产生的bam文件，有一些reads在cigar值里显示存在softclip，有一些存在hardclip，究竟softclip和hardclip是怎么判断出来的，还有是怎么标记duplicate的reads的，我怀着这些问题进行了探究。 测试步骤 编辑两个bed文件，分别含有我们需要的read1和read2位置，这里每个文件包含两条read1或者两条read2，read1、read2一对作为
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