peak差异分析的工具那么多,如何选择?

欢迎关注”生信修炼手册”! 对于ATAC_seq, chip_seq等抗体富集型文库而言,peak calling是分析的第一步。通过peak calling,可以得到抗体富集的区域,这些区域有对应的生物学功能,在chip_seq中,可以是转录因子结合区或者发生组蛋白修饰的区域,ATAC中对应的就是开放染色质区域。 上述各种测序研究的对象都是基因的表达调控,peak calling帮助我们得到调控
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