kraken软件操做手册

转录组数据质量分析完,想拿kraken软件分析下数据有没有微生物的序列污染html 找了全网没看见什么相关的指导文章,看官网的操做手册也很鸡助,因此本身翻译了官网手册以及写了代码,但愿对后来的人有些帮助。数据库 Kraken是2013年Wood提出的的宏基因组序列分类软件,可以快速对宏基因样品中的DNA序列进行分类,所以能够进行微生物检测。Kraken在序列比对环节(环节C)采用精确k-mer匹配
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