轻松理解BLAST搜索原理

时间 2021-01-05

标签算法数据库栏目 SQL 繁體版

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BLAST: Basic Local Alignment Search Tool 基于局部比对搜索工具（基于北京大学的生物信息学课程总结）序列比对一般使用动态规划算法 (Simith-waterman 算法) 来实现，对于两两比对(pairwise-alignment)而言，大O时间为Cmn (c为常量，表示单位操作时间， m， n分别为序列长度)。如果使用动态规划算法比对数据库中的每一条

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