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ubiome相似数据dada2处理探索4
时间 2020-07-05
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ubiome
相似
数据
dada2
dada
处理
探索
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前面咱们探索了处理不能拼接的V4 PE150数据,首先双向reads根据质量状况分别切成120bp,而后使用dada2 R包进行了直接+10N拼接,生成ASV表,再分别使用dada2包和qiime2进行了物种注释,基本上完成了一个最简单的分析过程,这里,使用比较流行的phyloseq包进行下多样性分析。html 说实话,以前从没有使用R进行过16S数据分析,通常认为R速度慢些,并且不熟悉。这里用了
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