Kubernetes 集群里的机器学习,Amazon SageMaker Operator 这个大管家你可必须认识一下

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机器学习不只仅关乎模型。ML工做流包括数据寻源和准备数据、构建ML模型、训练和评估模型、将模型部署到生产环境以及生产后持续监控。Amazon SageMaker可帮助用户更快地构建、训练、部署和维护模型。
可是,与构建模型相关的工做一般是规模更大的工做流的一部分,此工做流跨越了多个支持全局应用程序的工程团队和服务。Kubernetes用户(包括EKS客户)经过编写配置文件来部署工做负载,Kubernetes将这些配置文件与Kubernetes集群中的可用计算资源相匹配。虽然Kubernetes为用户提供了控制权和可移植性,但在Kubernetes集群上运行ML工做负载却会带来独特挑战。例如,底层基础设施须要额外的管理:针对利用率、成本和性能进行优化、符合适用的安全和法规要求,以及确保高可用性和可靠性等等。这些无差异的繁重工做占用了宝贵的时间和资源,延缓了将新的ML应用投入市场的速度。node

如何控制编排和工做流,同时又免于管理集群中的底层ML基础设施及服务?linux

Amazon SageMaker Operator能够帮助数据科学家以及开发人员利用Kubernetes接口来建立和管理SageMaker任务,如机器学习的模型训练、超参优化、批量转换以及实时推理等。
如图所示,SageMaker Operator可让开发与运维人员经过Kubectl命令行或者Kubernetes API接口调用的方式来管理和使用SageMaker服务,它就像翻译器同样,在Kubernetes平台与AWS SageMaker服务之间搭建了一座桥梁,让那些已经很很熟悉Kubernetes的开发、运维人员在无需投入过多精力的状况下,便可快速地使用SageMaker服务。git

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应用场景

SageMaker Operator可让那些已经很了解Kubernetes平台的开发人员以很是熟悉和友好的方式来使用SageMaker服务,它很是适用于如下一些场景。github

一、 项目团队已经很是熟悉Kubernetes平台的接口和标准,因为项目需求,但愿引进机器学习部分。因为人员数量有限,团队不但愿再去单独维护一套机器学习平台,而是在充分利用已有的能力的基础上,适当引进第三方的工具和服务,快速地进行业务创新,下降学习和使用的成本,大幅度提高效率。
二、 项目团队已在Kubernetes平台的基础上很好的实现了DevOps,不少业务模块都已经作到了持续集成与持续发布。机器学习部分只是整个业务系统中的一个模块,团队但愿可以能将机器学习模块与其它业务模块统一进行工程化的管理,最终实现业务流程的全自动化。算法

技术原理

与其它第三方应用的Kubernetes Operator实现机制同样,SageMaker Operator由Kubernetes CRD和Controller两部分组成。如图所示,在安装好SageMaker Operator以后,SageMaker Operator会向Kubernetes平台新注册一些与SageMaker服务相关CRD,同时以Pod的方式在Kubernetes Worker Node上运行SageMaker Operator Controller。当开发人员须要建立机器学习的任务时,首先须要在yaml文件中定义与CRD资源相关的关键配置参数,而后经过kubectl提交命令建立CRD资源,在CRD资源资源成功建立后,SageMaker Controller能够从Kubernetes API Server监听到与该CRD相关的信息,以后解析参数并调用SageMaker服务,完成机器学习任务的建立。json

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Operator是Kubernetes中一个重要概念,它可让开发人员在Kubernetes的基础上进行高级的抽象和封装,从而能够更加容易地安装和管理复杂的应用。除了SageMaker Operator,不少公司和开源机构都会按照Kubernetes的标准把封装本身的Operator。Kubernetes Operator概念相对抽象,技术实现细节也比较复杂,若想对它更深刻的了解,咱们首先须要理解Kubernetes资源建立的机制和流程,同时也须要理解Kubernetes CRD和Controller等一些重要的概念,本文不会就Kubernetes Operator的技术细节作过多的展开,关于更多有关Kubernetes Operator的介绍,请参考如下连接:api

  • Kubernetes CRD
  • Kubernetes Controller
  • Kubernetes Operator

实验演示

下文咱们将演示一个具体的例子,从而更好地说明如何如何利用AWS SageMaker Operator来实现机器学习任务的建立和管理。在该方案中,咱们会用到如下服务:安全

  • AWS S3:AWS对象存储服务,用于存放训练数据集以及机器学习模型。
  • AWS EKS:AWS Kubernetes托管服务,用于运行SageMaker Operator以及其它与Kubernetes相关的应用。
  • AWS SageMaker:AWS机器学习托管服务,用于实现数据处理、模型训练、模型优化以及模型部署等机器学习任务的自动化建立和管理。Operator会自动解析参数并调用SageMaker服务完成机器学习任务的建立。
  • AWS IAM:AWS安全管理服务,用于控制SageMaker Operator以及SageMaker对AWS资源的访问权限。
  • AWS CloudWatch:AWS日志管理服务,用于记录SageMaker机器学习任务的日志同时将日志以事实的方式推送至AWS EKS。

实验内容

搭建EKS集群,配置IAM权限,安装SageMaker Operator。bash

  • 经过kubectl命令建立SageMaker机器学习训练任务,提交任务后能够在SageMaker界面上看到机器训练任务,任务结束后确认模型会自动上传至S3。
  • 经过kubectl命令建立SageMaker机器学习部署的任务,提交任务后能够在SageMaker界面上看到机器学习部署任务,SageMaker会自动建立虚拟机并加载模型。

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实验步骤

一、EKS集群搭建

EKS是AWS的Kubernetes托管集群,咱们能够经过图形界面或者命令行的方式实现集群的建立。在本实验中,咱们在ap-southeast-1区域部署Kubernetes集群,该集群会包含一个Worker Node Group,该Node Group内有三个c5.xlarge的计算实例。在默认状况下,节点会采用高可用的方式均匀地部署在该区域的多个可用区内,若是有定制化需求,咱们也能够经过指定命令行参数或者编写配置文件来指定可用区。
1.1 运行命令,建立集群。app

eksctl create cluster --region <region-name> --name=<cluster-name> --nodes-min=3 --nodes-max=5 --node-type=c5.xlarge --ssh-access —ssh-public-key <ssh-keyname>

1.2 运行命令,查看Kubernetes节点的工做状态。

kubectl get node

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二、建立OpenID Connect Provider

OpenID Connect Provider能够将Kubernetes内的Service Account与AWS IAM的角色进行关联。在上文中咱们提到过,SageMaker Operator Controller会以Pod的方式运行在EKS节点上,该Pod在监听到资源的建立信息后会调用SageMaker服务,而成功调用SageMaker的前提是该Pod要具有相应的权限。咱们知道Kubernetes内Pod的权限分配通常是要经过Service Account传入的,因此OpenID Connect Provider的做用即是将集群外的IAM角色与集群内的Service Account进行关联。

2.1 运行命令获取OIDC ID。
请将${CLUSTERNAME}替换成实际的EKS集群名称,将${AWSREGION}替换成实际的Region。

aws eks describe-cluster --name ${CLUSTER_NAME} --region ${AWS_REGION} \
--query cluster.identity.oidc.issuer --output text

命令运行成功或会返回以下相似的结果:

https://oidc.eks.${AWS_REGION}.amazonaws.com/id/D48675832CA65BD10A532F597OIDCID

2.2 建立名为trust.json的文件。
文件模板以下所示。请将<OIDC ID>替换成为上一步获取的ID,将<AWS account number>替换成当前帐号的ID,将<EKS Cluster region>替换成EKS的名称。

{
  "Version": "2012-10-17",
  "Statement": [
    {
      "Effect": "Allow",
      "Principal": {
        "Federated": "arn:aws:iam::<AWS account number>:oidc-provider/oidc.eks.<EKS Cluster region>.amazonaws.com/id/<OIDC ID>"
      },
      "Action": "sts:AssumeRoleWithWebIdentity",
      "Condition": {
        "StringEquals": {
          "oidc.eks.<EKS Cluster region>.amazonaws.com/id/<OIDC ID>:aud": "sts.amazonaws.com",
          "oidc.eks.<EKS Cluster region>.amazonaws.com/id/<OIDC ID>:sub": "system:serviceaccount:sagemaker-k8s-operator-system:sagemaker-k8s-operator-default"
        }
      }
    }
  ]
}

使用上一步建立成功的trust.json文件,并运行下面命令建立IAM角色,将<role name>替换成本身须要的名称。

aws iam create-role --role-name <role name> --assume-role-policy-document file://trust.json --output=text

命令运行成功后会返回如图所示的结果:

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2.3 运行下列命令,将SageMaker FullAccess的权限赋予上一步所建立的角色。

aws iam attach-role-policy --role-name <role name> --policy-arn arn:aws:iam::aws:policy/AmazonSageMakerFullAccess

在完成角色的建立和权限的配置后,请记录角色的ARN,在后面建立SageMaker Operator时,咱们须要为SageMaker Operator配置该角色,从而确保SageMaker Operator Controller具有操做SageMaker的权限。

三、安装SageMaker Operator

SageMaker Operator的安装方式很灵活,咱们能够直接经过yaml文件进行部署或者经过Helm的方式进行安装部署,本次实验中咱们经过yaml的方式进行部署。在上文提到过,SageMaker Operator由CRD和Controller两部分组成,其中Controller会以Pod的形式运行在EKS Worker Node上。

3.1 运行命令下载用于安装SageMaker Operator的yaml文件。

wget https://raw.githubusercontent.com/aws/amazon-sagemaker-operator-**for**-k8s/master/release/rolebased/installer.yaml

3.2 下载完yaml文件后,进入文件内。
找到eks.amazonaws.com/role-arn参数项,将该参数对应的值更新为2.3步所建立角色的ARN。
3.3 运行下列命令安装SageMaker Operator

kubectl apply -f installer.yaml

上文曾提到,SageMaker Operator由CRD与Controller两部分组成,当SageMaker Operator安装成功后,SageMaker Operator会向Kubernetes集群内注册新的CRD,同时以Pod的形式在Kubernetes Worker Node上运行SageMaker Operator Controller。
3.4 运行下列命令查看新建立的CRD。

kubectl get crd | grep sagemaker

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3.5 运行下列命令查看新建立的SageMaker Operator Controller。

kubectl -n sagemaker-k8s-operator-system get pods

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4 安装SageMaker Operator日志插件

SageMaker日志插件是SageMaker Operator中的一个可选项,SageMaker的任务在运行过程当中会将日志推送至CloudWatch的日志组中,而SageMaker Operator日志插件则可实时地将CloudWatch日志收集到Kubernetes集群上,从而让开发人员经过kubectl命令查看SageMaker任务的日志。SageMaker Operator日志插件的安装是可选项,若安装则能够方便用户对日志进行管理,不安装也不会影响到任务自身的建立。

4.1 运行命令,安装SageMaker日志插件

export os="linux"
 
wget https://amazon-sagemaker-operator-for-k8s-us-east-1.s3.amazonaws.com/kubectl-smlogs-plugin/v1/${os}.amd64.tar.gz
tar xvzf ${os}.amd64.tar.gz
 
# Move binaries to a directory in your homedir.
mkdir ~/sagemaker-k8s-bin
cp ./kubectl-smlogs.${os}.amd64/kubectl-smlogs ~/sagemaker-k8s-bin/.
 
# This line will add the binaries to your PATH in your .bashrc.
 
echo 'export PATH=$PATH:~/sagemaker-k8s-bin' >> ~/.bashrc
 
# Source your .bashrc to update environment variables:
source ~/.bashrc

4.2 运行下列命令验证插件是否安装成功。

kubectl smlogs

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五、建立机器学习训练任务

接下来,咱们将建立一个SageMaker机器学习模型训练的任务,这里咱们以SageMaker内置算法xgboost为例,对MINIST数据集进行模型的训练和部署。

5.1 运行命令,生成数据集并将数据集上传至S3存储桶。
请将<BUCKET_NAME>替换成本身的S3存储桶名称。

`wget https://raw.githubusercontent.com/aws/amazon-sagemaker-operator-for-k8s/master/scripts/upload_xgboost_mnist_dataset/upload_xgboost_mnist_dataset \
chmod +x upload_xgboost_mnist_dataset \
./upload_xgboost_mnist_dataset --s3-bucket <BUCKET_NAME> --s3-prefix xgboost-mnist`

查看S3存储桶,能够发现训练、测试和验证数据集都已成功上传至S3存储桶上。

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5.2 运行命令建立SageMaker角色。
在建立SageMaker任务前,须要为SageMaker建立好角色,从而确保SageMaker能够顺利运行相关的任务。

export assume_role_policy_document='{
  "Version": "2012-10-17",
  "Statement": [{
    "Effect": "Allow",
    "Principal": {
      "Service": "sagemaker.amazonaws.com"
    },
    "Action": "sts:AssumeRole"
  }]
}'
aws iam create-role --role-name <execution role name> --assume-role-policy-document file://<(echo "$assume_role_policy_document")
aws iam attach-role-policy --role-name <execution role name> --policy-arn arn:aws:iam::aws:policy/AmazonSageMakerFullAccess

5.3 准备机器学习训练任务yaml文件。
在该文件中,须要配置与SageMaker训练任务相关的重要参数。关于机器学习训练任务yaml文件的模板请参考以下,请将变量部分替换成实际的参数,关键参数解释请参考模板中的备注信息。

apiVersion: sagemaker.aws.amazon.com/v1
kind: TrainingJob // CRD类型
metadata:
  name: xgboost-mnist
spec:
  roleArn: <Your SageMaker Role>  // 上一步建立的SageMaker role
  region: <Your-Region> // EKS集群所在的region
  algorithmSpecification:
    trainingImage: <Docker Image> // SageMaker XGboost镜像的存放位置,请参考SageMaker官方文档查看具体的镜像位置。
    trainingInputMode: File
  outputDataConfig:
    s3OutputPath: <s3://your-bucket/test> // 测试数据集存放位置
  inputDataConfig:
    - channelName: train
      dataSource:
        s3DataSource:
          s3DataType: S3Prefix
          s3Uri: <s3://your-bucket/train> // 训练数据集存放位置
          s3DataDistributionType: FullyReplicated
      contentType: text/csv
      compressionType: None
    - channelName: validation
      dataSource:
        s3DataSource:
          s3DataType: S3Prefix
          s3Uri: <<s3://your-bucket/validate> //验证数据集存放位置
          s3DataDistributionType: FullyReplicated
      contentType: text/csv
      compressionType: None
  resourceConfig:
    instanceCount: 1  // SageMaker实例数量
    instanceType: ml.m4.xlarge  //SageMaker实例类型
    volumeSizeInGB: 5 // SageMaker 根卷大小
  hyperParameters: // 超参设置,不一样的算法会有不一样的参数。
    - name: max_depth
      value: "5"
    - name: eta
      value: "0.2"
    - name: gamma
      value: "4"
    - name: min_child_weight
      value: "6"
    - name: silent
      value: "0"
    - name: objective
      value: multi:softmax
    - name: num_class
      value: "10"
    - name: num_round
      value: "10"
  stoppingCondition:
    maxRuntimeInSeconds: 86400

5.4 运行命令,建立SageMaker训练任务。

`kubectl apply -f train.yaml`

5.5 运行命令,查看SageMaker训练任务状态。

`$ kubectl describe trainingjob xgboost-mnist
$ kubectl get trainingjob xgboost-mnist`

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5.6 进入AWS控制台,查看AWS SageMaker训练任务状态。

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5.7 任务训练结束后,模型会被自动存放至S3。
进入S3控制台,能够查看到模型以及成功上传。

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六、模型部署

模型训练结束后,咱们将建立模型部署任务,SageMaker Operator会自动调用SageMaker服务完成模型的部署。
6.1 建立模型部署yaml文件。
在该文件中,咱们须要配置与SageMaker模型部署任务相关的重要参数。关于模型部署任务的yaml文件的模板请参考以下,请将变量部分替换成实际的参数,关键参数解释请参考模板中的备注信息。

apiVersion: sagemaker.aws.amazon.com/v1
kind: HostingDeployment //CRD类型
metadata:
  name: hosting-deployment
spec:
  region: <Your-Region> // EKS集群所在区域
  productionVariants:
    - variantName: AllTraffic
      modelName: xgboost-model
      initialInstanceCount: 1 // 部署实例类型数量
      instanceType: ml.r5.large //部署实例类型
      initialVariantWeight: 1
  models:
    - name: xgboost-model
      executionRoleArn: <Your SageMaker Role>  // 上一步建立的SageMaker role
      containers:
        - containerHostname: xgboost
          modelDataUrl: <S3://Your-Bucket/Model> //模型存放地址
          image: <Docker-Image> // SageMaker XGboost Docker 
Image地址,请参考SageMaker官方文档查看镜像具体存放位置。

6.2 运行命令查看模型部署任务状态

kubectl get hostingdeployments

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6.3 进入AWS控制台,查看SageMaker模型部署任务。

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在上面实验中,咱们举了模型训练和部署的例子,除了这两种任务,SageMaker Operator还支持参数优化、批量转换以及模型部署配置等其它任务,咱们能够根据项目中的实际需求灵活选择相对应的任务。

总结

利用SageMaker Operator,项目团队可使用所熟悉的Kubernetes命令以及接口管理复杂机器学习任务与流程,无需在已有的基础设施和平台上作出改动即可以快速地启动与机器学习相关的项目,从而极大程度地提高效率、下降成本。
在真实项目中,机器学习部分每每只是整个业务系统的一个模块,所以在设计方案时也须要系统性的考虑,除了机器学习流程自己,还须要考虑CI/CD、监控运维、安全控制、服务集成等多方面的因素。AWS能够作到服务之间的高度集成,在实际生产中,咱们彻底能够在上面实验案例的基础上进一步扩展,集成新的服务,从而构建一个端到端的解决方案。

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