HOWTO: 如何利用Avizo或Amira计算孔隙率（Porosity）

在作三维可视化数据处理过程当中，咱们常常要提取的一个基本信息就是孔隙率。在今天的文章中咱们要分享两个信息，一个是如何利用Avizo或Amira进行孔隙率计算；另外是关于Avizo 8.0中孔隙率计算异常的问题应对方法。

Avizo或Amira中如何计算孔隙率

孔隙率（Porosity），简单理解就是材料中孔隙体积与材料在天然状态下整体积的百分比。在Avizo和Amira中是利用Volume Fraction计算模块来提取孔隙率信息，基本步骤以下：

1. 分割获取孔隙（Foam示例中我只是简单利用交互阈值分割方式获取了孔隙，以下图）：

　　通常这里我会将得到的孔隙重命名为Pores。

2. 获取材料总体分割（相似步骤1，选择所有阈值范围，就能够得到整个材料的分割，不过注意，这里材料正好是正方形，若是是不规则材料，要考虑如何获取材料总体形态）

      

　　通常这里我会将分割得到的材料重命名为Mark。

3. 利用Volume Fraction进行孔隙率计算。

　　对Pores数据应用Volume Fraction，默认第一个参数就是Pores，第二个Input Image Mask咱们选择Mark，第三个参数Interpretation选择3D（若是选择XY，咱们能够得到面孔率），应用以后获取的结果点击Show，在Tables中展现出得到的孔隙率，以下图：

        

Avizo 8.0计算孔隙率异常的问题

　　使用Avizo 8.0的用户要注意，按照前面的方法计算孔隙率极可能是错误的，Avizo厂商在8.1的Release Notes中描述了这个问题“ 23292 Volume Fraction (Avizo Fire)

Volume Fraction could give incorrect values in some case when used with a mask.”

　　也就是说这个问题在8.1以后版本已经修正，因此这也提醒Avizo或Amira用户，软件及时更新很是重要。

　　那这里还提供一个临时方案，参考前边完成孔隙和材料总体的分割，而后利用Material Statistics对材料进行统计计算，获取的计算结果表中提取Volume列对应材料的体积数，而后相除，也能计算得到孔隙率。