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2020.9.15丨Chip-seq结果可视化之peak检测
时间 2021-01-19
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生物信息
R语言
Chip-seq
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macs2运行参数 macs2 callpeak -t K1_ChIPed_S1_L007_R1.bam -c K1_Input_S5_L007_R1.bam -f BAM -g mm -n K1 -B -q 0.01 -t -c 实验组和对照组结果 -f 输入文件格式 -g 参考基因组有效大小,人类选择hs,也可以根据基因组大小直接输入数值 -n 输出前缀 -B 输出bdg格式文件,可以上传到
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