NGS基础 - 参考基因组和基因注释文件

参考基因组和基因注释文件获取 通常测序生成的reads要与参考基因组或参考转录组进行比对，或Pseudo-alignment。所以首先需要获取参考基因组和参考转录组信息。 Ensembl(http://www.ensembl.org/info/data/ftp/index.html)是常用的信息齐全的参考基因组和GTF文件下载网站。 下图列出了几个常用动物物种的DNA序列和GTF格式的基因组注释。

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