Unsupervised clustering reveals new prostate cancer subtypes

摘要 背景:前列腺癌是男性中第二常见的癌症。发展基于基因的分类方法是迫切的要求。我们的目标是建立基因分型。 方法:我们使用了四个前列腺癌数据集。癌症基因组图谱(TCGA)RNA-Seq数据用于训练分类器。基于分类器的三个亚型被测试是否具有临床数据存在显着差异。其他三组按分类器分类并验证。 结果:分类器有183个基因。前列腺癌亚型1(PCS1)的特征是高 GSTP1的表达,Gleason评分较低(P
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