RPKM与TPM值的区别

对于RNA-Seq,目前主流还是用RPKM/FPKM来形容一个基因的表达量。有人说TPM更好。 RPKM定义:有一个基因A,它在这个样本的转录组数据中被测序而且mapping到基因组了 5000个的reads,而这个基因A长度是10K,我们总测序文库是50M,所以这个基因A的RPKM值是 5000除以10,再除以50,为10. 就是把基因的reads数量根据基因长度和样本测序文库来标准化(norm
相关文章
相关标签/搜索