centos6.4 下安装numpy、scipy、matplotlib

时间 2019-11-10

标签 centos6.4 centos 安装 numpy scipy matplotlib 栏目 CentOS 繁體版

原文原文链接

各个安装包版本：html

scipy-0.11.0python

numpy-1.6.2c++

nose-1.2.1后端

lapack-3.4.2工具

##atlas-3.10.0 (http://pkgs.fedoraproject.org/repo/pkgs/atlas/)测试

依赖关系：scipy的安装须要依赖于numpy、lapack、atlas（后二者都是线性代数工具包，不清楚的自行google之。。。），而numpy和sci的测试程序的运行又依赖于nose，所以，整个安装过程必需要按顺序执行的，不然是没法执行下去的。ui

sudo yum -y install gcc gcc-c++ numpy python-devel scipy

sudo pip install nose

sudo pip install numpy

主要是在安装scipy时问题多多:google

1. Blas(http://www.netlib.org /blas/) libraries not found.spa

Directories to search for the libraries can be specified in the.net

numpy/distutils/site.cfg file (section [blas])or by setting

the BLAS environment variable.

找不到blas

解决: yum install blas-devel

居然不出现BLAS的错误了

出现了LAPACK的错误

解决: yum install lapack-devel

而后, cd scipy-0.13.3 && sudo python setup.py install

顺利编译了

以后也顺利安装了

看网上说安装numpy前要安装gcc-gfortran、blas-devel、lapack-devel

没有遇到gcc-gfortran的错误，多是以前机器上装了吧

最后是 matplotlib安装....

所需依赖numpy, libpng 1.2 (or later), `freetype` 1.4 (or later), `dateutil` 1.1 or later, `pyparsing`

sudo -E /usr/local/bin/pip3 install python-dateutil
sudo -E /usr/local/bin/pip3 install pyparsing

wget http://download.savannah.gnu.org/releases/freetype/freetype-2.5.3.tar.gz

wget https://downloads.sourceforge.net/project/matplotlib/matplotlib/matplotlib-1.3.1/matplotlib-1.3.1.tar.gz

libpng-1.2.51.tar.gz

按照附带的安装文件说明安装便可.

编译安装是没什么问题

但是问题在安装后，import也没问题

但是就是show（）方法图像出不来

一直没反应

一直对着setup.py目录下的INSTALL文件的require那一段检查软件的版本

都没问题

网上也说matplotlib的会自动检查后端环境

CentOS下也已经有了Tkinter

后来用

yum install *-tk* 将两个以-tk结尾的软件装上

yum install *gtk2-* 将几个已gtk2开头的软件全装上

从新编译安装一次matplotlib

show（）就能够出现图像来了

可能那几个软件只要装某个就能够了，多装了一些

不过总算是把numpy、scipy和matplotlib都搞好了

附带:

Linux 安装 cblas, lapack, lapacke:

1.确保机器上安装了gfortran编译器，若是没有安装的话，可使用sudo apt-get install gfortran

2.下载blas, cblas, lapack 源代码，这些源码均可以在 http://www.netlib.org 上找到，下载并解压。这里提供我安装时的下载连接 http://www.netlib.org/blas/blas.tgz http://www.netlib.org/blas/blast-forum/cblas.tgz http://www.netlib.org/lapack/lapack-3.4.2.tgz，解压以后会有三个文件夹, BLAS, CBLAS, lapack-3.4.2

3.这里就是具体的编译步骤

1）编译blas，进入BLAS文件夹，执行如下几条命令

gfortran -c -O3 *.f # 编译全部的 .f 文件，生成 .o文件

ar rv libblas.a *.o # 连接全部的 .o文件，生成 .a 文件

su cp libblas.a /usr/local/lib # 将库文件复制到系统库目录

2）编译cblas，进入CBLAS文件夹，首先根据你本身的计算机平台，将目录下某个 Makefile.XXX 复制为 Makefile.in , XXX表示计算机的平台，若是是Linux，那么就将Makefile.LINUX 复制为 Makefile.in，而后执行如下命令

cp .. /BLAS/libblas .a testing # 将上一步编译成功的 libblas.a 复制到 CBLAS目录下的testing子目录

make # 编译全部的目录

sudo cp lib /cblas_LINUX .a /usr/local/lib/libcblas .a # 将库文件复制到系统库目录下

3）编译 lapack以及lapacke，这一步比较麻烦，首先固然是进入lapack-3.4.2文件夹，而后根据平台的特色，将INSTALL目录下对应的make.inc.XXX 复制一份到 lapack-3.4.2目录下，并命名为make.inc, 这里我复制的是 INSTALL/make.inc.gfortran，由于我这里用的是gfortran编译器。

修改lapack-3.4.2/Makefile, 由于lapack以来于blas库，因此须要作以下修改

#lib: lapacklib tmglib

lib: blaslib variants lapacklig tmglib

而后执行如下命令：

make # 编译全部的lapack文件

cd lapacke # 进入lapacke 文件夹，这个文件夹包含lapack的C语言接口文件

make # 编译lapacke

cp include/*.h /usr/local/include #将lapacke的头文件复制到系统头文件目录

cd .. #返回到 lapack-3.4.2 目录

cp *.a /usr/local/lib # 将生成的全部库文件复制到系统库目录

这里的头文件包括： lapacke.h, lapacke_config.h, lapacke_mangling.h, lapacke_mangling_with_flags.h lapacke_utils.h

生成的库文件包括：liblapack.a, liblapacke.a, librefblas.a, libtmglib.a

至此cblas和lapack就成功安装到你的电脑上了。

测试：

能够到 http://www.netlib.org/lapack/lapacke.html 找测试代码，这里lapacke的官方文档，好比以下代码：

#include <stdio.h>

#include <lapacke.h>

int main ( int argc, const char * argv[])

{

double a[5*3] = {1,2,3,4,5,1,3,5,2,4,1,4,2,5,3};

double b[5*2] = {-10,12,14,16,18,-3,14,12,16,16};

lapack_int info,m,n,lda,ldb,nrhs;

int i,j;

m = 5;

n = 3;

nrhs = 2;

lda = 5;

ldb = 5;

info = LAPACKE_dgels(LAPACK_COL_MAJOR, 'N' ,m,n,nrhs,a,lda,b,ldb);

for (i=0;i<n;i++)

{

for (j=0;j<nrhs;j++)

{

printf ( "%lf " ,b[i+ldb*j]);

}

printf ( "\n" );

}

return (info);

}

将上诉代码保存为test.c，编译时，别忘了使用gfortran，此外，还须要链接用到的库，编译上面的代码，应使用以下命令:

1	`gfortran` `test` `.c -llapacke -llapack -lrefblas`

若是能正常编译，即表示安装成功。若是要了解这段代码的具体含义，能够到 http://www.netlib.org/lapack/lapacke.html 查看