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基因数据处理123之SSW代码不正确,到时比SparkSW时间长
时间 2019-12-04
标签
基因
数据处理
ssw
代码
不正确
到时
sparksw
时间
栏目
大数据
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更多代码请见:https://github.com/xubo245git 基因数据处理系列github 1.解释 因为要生成新的score matrix:blosum50,第一次使用静态方法,直接传给align,到时每次运行都须要进行一次score matrix的计算,而这个是将blosum50的矩阵转换成128*128的矩阵,当计算Q0,即8个字符串的query时,显然时间占比大,原本序列比对时
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