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分析方法升级&三代测序辅助,优化无参转录组测序策略
时间 2020-12-31
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第三代测序 技术
基因组组装assembly
生物信息学
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分析方法升级&三代测序辅助,优化无参转录组测序策略 无参转录组拼接升级 Corset 让“基因”概念更准确 在无参转录组项目中,利用主流软件 Trinity 进行 De novo 拼接转录本, 而后选取最长的转录本作为 unigene 进行后续分析。 但是研究表明,完全以 unigene 作为基因的替身,有失恰当。 因为,拼接出来的最长转录本会掩盖掉本应真实的较短转录本(基因的 isoform)所
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