以前小编已经给你们推荐过几个单细胞数据库：PanglaoDB、SpatialDB、CancerSEA...web
此次，一次性推荐两大单细胞经典数据库：scRNASeqDB和SCPortalen。数据库
scRNASeqDBexpress
第一我的类单细胞转录组数据库微信
这个数据库是由美国的研究人员开发的，包含了目前几乎全部可用的人类单细胞转录组数据集（n=38），覆盖200我的类细胞系或细胞类型和13440个样本。工具
scRNASeqDB数据库大数据
scRNASeqDB能作什么？spa
用户可根据基因或细胞类型搜索基因表达的信息，同时scRNASeqDB还提供可查询和可视化工具，包括基因、细胞类型或群体间差别表达基因的注释信息，另外用户还能够经过Dataset View功能浏览数据库的数据信息。.net
按基因名称搜索功能示例3d
用基因名称或ID搜索，获得目标基因在各数据集中的表达状况，点击gene view按钮，便可查看基因的通常信息、表达的热图/盒形图及列表、与目标基因最相关的100个基因的功能注释。blog
按细胞类型搜索功能示例
用细胞类型搜索，获得细胞类型相关的数据集列表，点击细胞类型名称进入Cell view，用户能够查看查询的Cell类型中排序的基因以及该特定Cell类型中两个基因之间的关系。
Browse功能示例
用户可以使用Browse功能经过Dataset View查询数据集的全面描述信息，经过归因和降维聚类的方法用于基于数据集构建细胞簇。同时，显示数据集中两个细胞类型之间差别表达基因的列表以及差别表达基因的GO和KEGG注释。
SCPortalen
以人类和小鼠为中心的单细胞数据库
这个数据库是由日本的研究人员开发的，涵盖了人类和小鼠单细胞转录组学全面的元数据和转录组数据以及细胞图像信息。
SCPortalen数据库
SCPortalen能作什么？
经过SCPortalen的web界面，用户能够轻松地搜索、浏览和下载感兴趣的单细胞数据集。
SCPortalen数据库功能示例
用户可经过细胞图像数据集和转录组数据集两个模式使用SCPortalen数据库，以转录组数据集模式为例，点击进入转录组数据集页面，能够了解数据集的基本信息，数据保存地址，下载PCA，t-SNE等图片信息，还能够搜索某个基因表达的FPKM值。
以上两大数据库中收录了目前已发表的单细胞数据信息，你们能够下载这些数据自行分析，或利用数据库自带的工具查询验证本身的实验结果。
scRNASeqDB访问地址：https://bioinfo.uth.edu/scrnaseqdb/.
SCPortalen访问地址：http://single-cell.clst.riken.jp/.
小编碎碎念
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参考文献
[1] Cao Y, Zhu J, Jia P, et al. scRNASeqDB: a database for RNA-Seq based gene expression profiles in human single cells[J]. Genes, 2017, 8(12): 368.
[2] Abugessaisa I, Noguchi S, Böttcher M, et al. SCPortalen: human and mouse single-cell centric database[J]. Nucleic acids research, 2018, 46(D1): D781-D787.
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本文分享自微信公众号 - 国家基因库大数据平台（close_3080908629）。
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